Karine Jean-Baptiste étudie le violoncelle et le piano. Elle entre dans la classe de Maurice Gendron puis dans celle de Roland Pidoux au CNSMD de Paris. Elle obtient ses diplômes en 1988 (violoncelle et musique de chambre) avec Geneviève Joy et Christian Ivaldi. Depuis 1991, elle est titulaire à l’Orchestre Philharmonique de Radio France et se produit régulièrement dans l’octuor des Phil’Art’Cellistes, constitué par le pupitre de l’orchestre. De 1996 à 2001, elle a bénéficié de l’enseignement des membres du Quatuor Alban Berg et de Walter Levin. Le Quatuor Così, dont elle fait partie, remporte le premier prix du Concours international d’Illzaach. Karine Jean-Baptiste se produit en compagnie de diverses formations au Festival de Fontainebleau, au musée d’Orsay, aux Rencontres de violoncelle de Bélaye, à l’Abbaye de l’Épau...). En 2010, à la demande d’Anne Sicco, directrice de la compagnie L’Œil du silence, elle réalise un spectacle musical et poétique autour de Clément Marot. Elle anime par ailleurs des ateliers-concerts pour les enfants, mais aussi auprès d’adultes en situation de précarité.
L’Histoire de la petite sirène